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產品分類熒光定量PCR 因操作方便、運行速度快、實驗結果準確,受到越來越多的分子生物學研究者青睞。在實驗過程中您又該如何準確操作熒光定量PCR儀呢?今天小編就為您列舉一款熒光定量PCR儀的操作步驟:
ABI Prism 7000型定量PCR儀
1、新建文件菜單File → New,Assay選擇Absolute Quantification(實時定量模式),打開一個空白的96孔板文件。
2、探針設置雙擊任意一個孔,打開Well Inspector窗口。該窗口也可以從菜單View → Well Inspector打開。
3、使用軟件,或者探針(Detector)沒有設置好,請點擊Add Detector按鈕,打開Detector
Manager窗口。該窗口也可以從菜單Tools → Detector Manager打開。如果Detector列表中沒有合適的探針,點擊按鈕File →
New,新建探針:設定探針的名稱(建議使用所研究基因符號加標記熒光,如GAPDH_FAM、ACTIN_VIC等)、報告基團(FAM或者VIC)、淬滅基團(TaqMan探針選TAMRA;MGB探針選None)、顏色(任意)等。設置完成后點擊OK,該探針即出現在探針列表中。重復此過程,設立其他的探針。
4、在Detector Manager窗口,從探針列表中點擊選擇所需探針,按住Ctrl鍵可以選擇多個探針,再點擊Add to Plate
Document按鈕。較為后點擊Done關閉Detector Manager窗口。此時Well Inspector窗口仍然是打開的。
5、填樣品表在96孔表中選定有樣品的一個或多個孔,在Well Inspector頁面的Sample
Name欄中填入樣品名稱;在探針列表的Use項下的方框中,打鉤選擇要用的一個或多個探針;在Task欄中選擇樣品類領:陰性對照選NTC;未知樣品選Unknown;標準品選Standard。對于Standard,還要在Quantity欄中輸入DNA拷貝數。注意:只有在這里輸入拷貝數后,軟件才能自動生成標準曲線。建議標準品的濃度在5點以上。建議每個樣品(包括標準品)都按照統計學要求作一定數量的復管。
6、參比熒光如果使用的是ABI公司的定量PCR試劑,如TaqMan Universal PCR Master Mix或者SYBR Green PCR
Master Mix等,參比熒光(Passive
Reference)選ROX;如果使用的試劑中不含有參比熒光,請選None。完成后點擊右上角的X按鈕,關閉Well Inspector窗口。
7、循環參數切換到Instrument頁面,設定及修改PCR熱循環程序:在ABI公司默認的程序中,50℃
2
min是UNG酶起作用的步驟,UNG酶可以預防PCR產物(其中以U代替T)對定量PCR的污染;95℃ 10
min的作用是激活Taq酶,同時滅活UNG酶;40個循環的95℃ 15 sec和60℃ 1
min是定量PCR的循環步驟。7000默認在較為后一步,也就是60℃ 1
min復性和延伸時收集熒光信號。如果使用ABI公司的定量PCR試劑,上述參數不需要調整,直接運行PCR循環就可以了。在使用其他廠家試劑的情況下,如果其中沒有UNG酶,請刪除50℃
2 min步驟;如果使用的不是Taq酶而是其他普通的Taq酶,請刪除95℃ 10 min步驟。
8、循環參數的修改方法刪除:按住Shift鍵并在相應的Stage或Step中點擊,使該步驟被選中變黑,再按Del鍵即可刪除。插入:在需要插入參數的位置點擊,出現粗黑豎線后,分別點擊Add
Hold、Add Cycle或Add
Step按鈕添加保溫、循環或循環中的一個步驟。修改溫度和時間:拖動鼠標,選中需要修改的溫度或時間數字,輸入新的數值即可。
9、其他設置反應體積:定量PCR的標準反應體積是50 µL;如果想修改的話,建議大于25 µL。融解曲線試驗:在Dissociation
Protocol選項左邊的方框中打鉤,儀器即在定量PCR循環完成后繼續做融解曲線試驗。如果是采用SYBR Green
I染料方法進行定量研究,建議進行融解曲線試驗,以判定PCR反應特異與否。單峰表示單一的PCR擴增產物,多峰表示PCR擴增有雜帶。注意:只有SYBR
Green I染料方法才需要進行融解曲線試驗,TaqMan探針和MGB探針法都不需要。9600
Emulation:選中此項,即可使7000的升降溫速度減慢,與9600和7700一樣,從而可以直接使用在9600、7700型PCR儀上優化好的循環條件,而不需任何修改。
10、啟動擴增點Save按鈕保存文件設置。確認96孔板或全部樣品管在主機內放置妥當后,點擊Start按鈕,開始PCR循環。屏幕上動態顯示PCR進程和剩余時間。
11、監控進程切換到Results頁面的Amp
Plot子頁面,可以實時顯示PCR曲線隨著循環增加而逐步增長的實際情況。如果Detector選FAM或VIC,只顯示對應探針的變化情況;如果選All,則同時顯示所有探針的反應進程。
12、保存結果程序結束后,點Disconnect按鈕,然后File →
Save保存實驗結果。可以保存為.sds格式,也可以保存為.sdt格式,作為以后同類實驗的模板,節省軟件設置時間。
以上的內容就是今天小編要和大家分享的內容,希望對大家有所幫助,如想了解更多關于pcr儀或是有意向購買者,巴玖會給您一個滿意的服務!
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